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微生物學(xué)



Cell:首次發(fā)現(xiàn)母親和嬰兒機(jī)體腸道微生物組之間或許存在水平基因轉(zhuǎn)移現(xiàn)象

2023-01-09微生物學(xué)


圍產(chǎn)期是機(jī)體認(rèn)知和免疫系統(tǒng)發(fā)育的關(guān)鍵窗口,其會(huì)通過(guò)母體和嬰兒的腸道微生物組以及其代謝產(chǎn)物而促進(jìn)。近日,一篇發(fā)表在國(guó)際雜志Cell上題為“Mobile genetic elements from the maternal microbiome shape infant gut microbial assembly and metabolism”的研究報(bào)告中,來(lái)自赫爾辛基大學(xué)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過(guò)研究發(fā)現(xiàn)了一種新型的母嬰微生物組傳播模式,即在圍產(chǎn)期內(nèi)母體腸道中的微生物會(huì)與嬰兒腸道中的微生物共享基因,而且這種模式從嬰兒出生前就開(kāi)始了,并且會(huì)延伸到其出生后的頭幾周,這種水平基因轉(zhuǎn)移就能允許母源性的微生物影響嬰兒機(jī)體微生物組的功能,而微生物組菌株本身并沒(méi)有進(jìn)行持續(xù)性的傳播。

在這篇大規(guī)模的綜合性分析中,研究人員提供了一系列腸道定植動(dòng)態(tài)學(xué)變化的高分辨率快照信息,這種動(dòng)態(tài)學(xué)變化或許會(huì)影響嬰兒出生前后的機(jī)體發(fā)育。研究者Ramnik Xavier說(shuō)道,這項(xiàng)研究中,我們首次描述了母體和嬰兒機(jī)體微生物組移動(dòng)遺傳元件的轉(zhuǎn)移,同時(shí)我們還整合了來(lái)自母親和嬰兒體內(nèi)的腸道微生物組及其代謝組學(xué)特征,結(jié)果發(fā)現(xiàn)了腸道代謝產(chǎn)物、細(xì)菌和母乳底物之間的關(guān)聯(lián),這項(xiàng)調(diào)查代表了在已知的母源性和膳食因素的影響下,嬰兒腸道微生物組和代謝組共同發(fā)育的獨(dú)特視角。

腸道菌群能部分通過(guò)微生物代謝產(chǎn)物的產(chǎn)生來(lái)促進(jìn)機(jī)體免疫系統(tǒng)的成熟,嬰兒腸道微生物組的發(fā)育遵循著可預(yù)測(cè)的模式,即從出生時(shí)母親傳遞的微生物開(kāi)始,除了免疫系統(tǒng)成熟外,微生物的代謝產(chǎn)物還影響著機(jī)體早期的認(rèn)知功能發(fā)育。圍產(chǎn)期對(duì)于機(jī)體認(rèn)知和免疫系統(tǒng)的發(fā)育非常關(guān)鍵,盡管如此,在圍產(chǎn)期機(jī)體微生物組和代謝組的共同發(fā)育以及這一過(guò)程的決定因素,科學(xué)家們并未很好地理解。為了填補(bǔ)這一知識(shí)空白,研究人員對(duì)來(lái)自70個(gè)母嬰組合隊(duì)列的縱向多組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,從孕晚期到嬰兒出生一歲時(shí)追蹤其與母親體內(nèi)的微生物組和代謝組的共同發(fā)育情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)了大規(guī)模的母親-嬰兒機(jī)體之間移動(dòng)遺傳元件的轉(zhuǎn)移,其經(jīng)常涉及與飲食相關(guān)的適應(yīng)性存在關(guān)聯(lián)的基因。

首次發(fā)現(xiàn)母親和嬰兒機(jī)體腸道微生物組之間或許存在水平基因轉(zhuǎn)移現(xiàn)象。

圖片來(lái)源:Cell (2022). DOI:10.1016/j.cell.2022.11.023.

研究者表示,嬰兒腸道代謝組的多樣性不如母體的代謝組多樣性,但有數(shù)百種特殊的代謝產(chǎn)物以及微生物-代謝產(chǎn)物的關(guān)聯(lián)在母體中并未被檢測(cè)到,接受常規(guī)但并非廣泛的水解配方奶粉的嬰兒機(jī)體中的代謝組和血清細(xì)胞因子特征與純母乳喂養(yǎng)的嬰兒并不相同。研究者Tommi Vatanen說(shuō)道,嬰兒的腸道中擁有數(shù)千種獨(dú)特的代謝產(chǎn)物,其中很多都是由腸道菌群對(duì)母乳中的底物修飾而產(chǎn)生,這些代謝產(chǎn)物中的很多都可能會(huì)影響機(jī)體免疫系統(tǒng)的功能和認(rèn)知功能的發(fā)育。懷孕與類(lèi)固醇化合物水平升高直接相關(guān),包括性腺激素衍生物和膽汁酸生物合成中間體,其中一些與機(jī)體葡萄糖耐受損傷之間存在著獨(dú)立的關(guān)聯(lián);盡管嬰兒機(jī)體腸道代謝組的多樣性不如母體中的代謝組,但研究人員發(fā)現(xiàn)了2500多個(gè)嬰兒特異性的代謝組特征,此外,他們還識(shí)別出了多種嬰兒特有的細(xì)菌種類(lèi)和糞便代謝產(chǎn)物的關(guān)聯(lián),其中包括神經(jīng)遞質(zhì)和免疫調(diào)節(jié)劑等。

研究人員很驚訝地發(fā)現(xiàn),在嬰兒機(jī)體中很少觀察到的母源性腸道菌群或許對(duì)于嬰兒腸道微生物組的結(jié)構(gòu)有著特殊的貢獻(xiàn),此外還有研究證據(jù)表明,前噬菌體(prophages,休眠的噬菌體或定植在細(xì)菌基因組上的病毒)或許會(huì)促進(jìn)母體和嬰兒微生物組之間可移動(dòng)遺傳元件的交流。研究者指出,除了經(jīng)典的菌種和物種的垂直傳播外,母源性的微生物組或許會(huì)通過(guò)水平基因轉(zhuǎn)移的方式來(lái)塑造嬰兒機(jī)體的腸道微生物組,此外,識(shí)別出嬰兒腸道中獨(dú)特的代謝組特征以及微生物-代謝物相互作用或許有望幫助研究人員開(kāi)發(fā)出一種新型平臺(tái)來(lái)進(jìn)一步研究微生物對(duì)嬰兒機(jī)體發(fā)育的貢獻(xiàn)和作用。

目前本文研究的局限性在于,研究人員并未考慮到女性懷孕和產(chǎn)后期間飲食和生活方式的改變,這或許也會(huì)影響機(jī)體的微生物組和代謝組特征;未來(lái)研究中,研究人員計(jì)劃進(jìn)一步研究來(lái)分析細(xì)菌和代謝組之間的關(guān)聯(lián),并利用體外分離的細(xì)菌來(lái)研究菌種特異性的細(xì)菌代謝輸出特征。綜上,本文研究結(jié)果表明,這項(xiàng)綜合性的分析或許擴(kuò)大了腸道微生物組垂直傳播的概念,并對(duì)孕晚期和嬰兒生命早期母嬰機(jī)體的微生物組和代謝組的發(fā)育提供了新的研究思路和見(jiàn)解。(Bioon.com)

原始出處:

Tommi Vatanen,Karolina S. Jabbar,Terhi Ruohtula, et al. Mobile genetic elements from the maternal microbiome shape infant gut microbial assembly and metabolism, Cell (2022). DOI: 10.1016/j.cell.2022.11.023

文章評(píng)論

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