Nature:潛在的致命感染在我們的腸道中潛伏著危險的盟友
弗吉尼亞大學醫學院的Jason Papin博士及其合作者的一項新發現可以幫助醫生識別患有嚴重艱難梭菌的患者,并為新的治療方法打開大門。
來源:Dan Addison | UVA Communications
艱難梭菌(Clostridioides difficile)通常被稱為C. difficile或C. diff,其是一種會引發嚴重腸道疾病的細菌,正如其名字那樣,這種細菌難以研究且其感染難以治療;大約六分之一被感染的個體都會在兩個月內疾病再次復發,然而,目前科學家們并沒有闡明為何相比一些人而言,在另一些人群中,艱難梭菌的感染非常難以治療。人類的腸道中充滿了數以萬億計的微生物,這些微生物會影響多種病原體的毒力,截止到目前為止,科學家們很少理解艱難梭菌如何與胃腸道中豐富的微生物進行相互合作。
近日,弗吉尼亞大學醫學院及其合作者的新研究揭示了一種抗生素耐藥性的機會致病菌:腸球菌或能與艱難梭菌相互協作,重塑并增強腸道中的代謝環境,從而使得艱難梭菌不斷茁壯成長。這一發現可以幫助醫生識別患有嚴重疾病的患者,并為新的治療方法打開大門。
UVA的新發現有助于解釋為什么某些患者面臨特殊的風險。研究人員確定,在腸道中發現的一組耐抗生素的“機會性病原體”,即腸球菌,可以使c . diff更強大也更危險。
“人與人之間的互動,其他微生物和人體腸道非常復雜。這項研究利用了來自多個機構的大型多學科團隊的專業知識,來解開這些復雜的相互作用,有了更深入的了解,我們就有機會開發新的治療策略來治療這種危險的感染。”
腸球菌是一種細菌,它們本身就能引起難以治療的危險感染。例如,它們會導致腦膜炎、尿路感染(老年人可能會非常嚴重)、痛苦的胃腸道疾病憩室炎,以及其他疾病。但研究人員發現,它們構成的威脅還不止于此。
研究小組收集了患有糖尿病的患者的糞便樣本,然后,他們結合實驗室測試和先進的計算機建模來更好地理解這一點c . diff與腸道內的其他微生物相互作用。
他們發現腸球菌是危險的盟友, 腸球菌產生氨基酸,包括亮氨酸和鳥氨酸,它們使艱難梭菌對于腸道成分被抗生素破壞的患者來說,這是一個更大的威脅。
帕平和他的團隊開發了強大的計算機模型,幫助研究人員理解和預測腸道的復雜變化。他們的工作與其他實驗室進行的實驗室研究相結合,表明腸球菌可以極大地重塑腸道中的“代謝組”——氨基酸等代謝物的集合。研究人員報告說,這些變化最終會重新編程,并增強其致病行為。
“Matthew Jenior (Papin實驗室UVA博士后)進行的計算建模有助于發現氨基酸在相互作用中的作用c . diff和腸球菌,他們構建的計算模型將繼續幫助我們更好地理解大腦中的分子過程c . diff會導致疾病。”
通過更好地理解c . diff,研究人員說菌與腸道中的腸球菌和其他微生物相互作用,醫生將更好地對抗這種常見的嚴重感染。
“生物學是一門數據豐富的科學,利用這些數據的計算模型的能力才剛剛起步,我們對利用數據科學和計算機建模來推動生物發現的無數機會感到興奮。”
原文標題:
Enterococci enhance Clostridioides difficile pathogenesis
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