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分子生物學



中科院化學所汪銘團隊開發(fā)細胞選擇性CRISPR-Cas9基因編輯工具

2023-01-03分子生物學


CRISPR-Cas9是基于細菌/古菌的獲得性免疫系統(tǒng)而開發(fā)的新一代基因編輯技術,在化學生物學、生物醫(yī)學及基因治療中具有潛在應用前景。CRISPR-Cas9技術使用向導RNA(sgRNA)識別靶標基因,并招募Cas9核酸酶對基因組進行切割、編輯等操作。

然而,由于sgRNA識別基因組存在非特異性結合作用,現(xiàn)有CRISPR-Cas9技術應用于基因編輯時存在一定的脫靶效應,且缺乏對疾病細胞的選擇性,限制了其在化學生物學領域的應用。 

中國科學院化學研究所研究員汪銘課題組在 JACS 上發(fā)表了題為:Orthogonal Chemical Activation of Enzyme-Inducible CRISPR/Cas9 for Cell-Selective Genome Editing 的研究論文。

該研究開發(fā)了一種正交化學激活的酶誘導的CRISPR系統(tǒng)(eiCRISPR)實現(xiàn)了細胞選擇性基因編輯。該方法為解決CRISPR-Cas9技術中面臨的基因編輯脫靶效應以及缺乏疾病靶向性等挑戰(zhàn)提供了新策略。

汪銘課題組圍繞可控及細胞選擇性CRISPR-Cas9技術開展研究,發(fā)展了酶誘導的CRISPR系統(tǒng)(enzyme-inducible CRISPR,eiCRISPR)實現(xiàn)了細胞選擇性基因編輯

eiCRISPR由三部分組成,包括Cas9核酸酶、自封閉失活的向導RNA(bsgRNA)以及化學修飾的脫氧核酶DNAzyme,其中DNAzyme可特異性降解bsgRNA的自封閉區(qū)進而激活CRISPR系統(tǒng)。

為了實現(xiàn)可控及細胞選擇性基因編輯,他們通過設計優(yōu)化DNAzyme磷酸骨架的化學修飾,抑制了其降解bsgRNA自封閉區(qū)的能力;而外源性光信號、內源性化學微環(huán)境(如細胞內活性氧、NQO1酶)等可選擇性觸發(fā)化學修飾DNAzyme的脫籠反應,激活DNAzyme并降解bsgRNA的自封閉區(qū),進而激活eiCRISPR系統(tǒng)。

酶促反應激活的細胞選擇性CRISPR-Cas9基因編輯系統(tǒng)

 

研究團隊進一步利用其發(fā)展的可降解脂質納米顆粒(LNP)遞送系統(tǒng),實現(xiàn)了細胞及活體層次eiCRISPR的高效遞送和在體激活。研究發(fā)現(xiàn),eiCRISPR可在腫瘤組織中被選擇性激活,并編輯、敲低人乳頭瘤病毒18(HPV18)E6基因,從而可用于潛在的腫瘤治療。

該方法為解決CRISPR-Cas9技術中面臨的基因編輯脫靶效應以及缺乏疾病靶向性等挑戰(zhàn)提供了新策略。

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