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肝膽胰腫瘤



Nature子刊:浙大易文/周如鴻合作揭示糖基化調(diào)控胰腺癌新機(jī)制

2022-07-28肝膽胰腫瘤


胰腺癌是一種惡性程度極高的消化系統(tǒng)腫瘤,確診后患者的五年生存率僅為10%左右。代謝的改變是腫瘤細(xì)胞的重要特征之一。腫瘤細(xì)胞通過代謝重編程產(chǎn)生其快速增殖所需的物質(zhì)、能量以及氧化還原力。癌基因Kras突變的胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC,胰腺癌中最常見的病理類型)的增殖高度依賴谷氨酰胺(Gln)分解代謝途徑。在該途徑中,Gln首先被轉(zhuǎn)化成天冬氨酸(Asp),隨后在谷草轉(zhuǎn)氨酶(GOT1)催化下形成草酰乙酸(OAA),OAA經(jīng)蘋果酸脫氫酶(MDH1)催化進(jìn)一步被轉(zhuǎn)化為蘋果酸(Malate),再經(jīng)蘋果酸酶(ME1)氧化最終形成丙酮酸(Pyruvate)和NADPH;后者能提供還原當(dāng)量,維持細(xì)胞內(nèi)氧化還原平衡。該途徑對(duì)于PDAC細(xì)胞的增殖和存活至關(guān)重要,因此深入了解這一途徑的調(diào)控機(jī)制有助于為PDAC的臨床治療提供新的思路和靶點(diǎn)。

O-GlcNAc糖基化修飾是通過N-乙酰葡糖胺以β-糖苷鍵形式共價(jià)連接到蛋白質(zhì)的絲氨酸(Ser)或蘇氨酸(Thr)羥基上的一種翻譯后修飾。該修飾是一種高度動(dòng)態(tài)的修飾方式,會(huì)隨著細(xì)胞內(nèi)的營養(yǎng)狀態(tài)和細(xì)胞外的刺激發(fā)生變化。該修飾廣泛發(fā)生在細(xì)胞內(nèi)的蛋白上,并調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄、信號(hào)傳導(dǎo)、蛋白合成和代謝重編程等重要的生物學(xué)過程。之前的研究表明O-GlcNAc糖基化修飾水平在PDAC中異常增高。然而O-GlcNAc糖基化調(diào)控PDAC發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制尚不清楚。

2022年7月25日,浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院易文教授課題組和周如鴻教授課題組合作在 Nature Chemical Biology 雜期刊在線發(fā)表了題為:O-GlcNAcylation promotes pancreatic tumor growth by regulating malate dehydrogenase 1 的研究論文。

該研究通過糖化學(xué)生物學(xué)、腫瘤生物學(xué)和計(jì)算生物學(xué)多學(xué)科交叉手段,揭示了O-GlcNAc糖基化調(diào)控谷氨酰胺代謝,促進(jìn)PDAC生長的分子機(jī)制。

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研究首先發(fā)現(xiàn)介導(dǎo)O-GlcNAc修飾的糖基轉(zhuǎn)移酶OGT的表達(dá)在胰腺癌病人組織中顯著升高;敲低OGT顯著抑制了PDAC細(xì)胞的Gln代謝,抑制了PDAC細(xì)胞增殖。

進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)O-GlcNAc修飾對(duì)Gln代謝途徑中的關(guān)鍵酶MDH1的功能有顯著影響。通過高分辨質(zhì)譜結(jié)合點(diǎn)突變的方法鑒定出Ser189位為MDH1的糖基化修飾位點(diǎn)。體外的酶活實(shí)驗(yàn)表明Ser189位上的糖基化可以增強(qiáng)其酶活性。靶向代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)證實(shí)了MDH1糖基化促進(jìn)Gln代謝和NADPH的產(chǎn)生。

此外,MDH1參與細(xì)胞內(nèi)協(xié)調(diào)糖酵解和線粒體呼吸作用的蘋果酸-天冬氨酸穿梭途徑;MDH1糖基化會(huì)有利于NADH的再生,從而促進(jìn)的線粒體的呼吸。小鼠體內(nèi)成瘤實(shí)驗(yàn)和臨床樣本分析也進(jìn)一步驗(yàn)證了MDH1 Ser189位的糖基化修飾對(duì)PDAC生長的促進(jìn)作用。

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圖1:MDH1 Ser189位的糖基化修飾促進(jìn)了其酶活以及PDAC生長

為了進(jìn)一步了解O-GlcNAc糖基化增強(qiáng)MDH1酶活性的分子機(jī)制,作者利用全原子分子動(dòng)力學(xué)模擬對(duì)MDH1單體-底物(NADH,MAK)復(fù)合物在Ser189糖基化和非糖基化狀態(tài)下的動(dòng)力學(xué)行為進(jìn)行了探究。結(jié)果表明底物在糖基化情況下更加穩(wěn)定,結(jié)合概率更高。這得益于Ser189 O-GlcNAc對(duì)底物結(jié)合口袋的保護(hù),促使MDH1與底物,底物與底物之間相互作用增強(qiáng);MDH1和底物之間增強(qiáng)的相互作用主要來自Ser189 O-GlcNAc與蛋白殘基Gln228、Gln229和Arg98的接觸貢獻(xiàn)。相應(yīng)的三聯(lián)體突變(Q228A/Q229A/R98A)活性分析實(shí)驗(yàn)也證實(shí)了這一觀察結(jié)果。

此外,與單體不同,MDH1二聚體在非糖基化和糖基化狀態(tài)下的底物結(jié)合并沒有表現(xiàn)出顯著差異。這可能是由于參與底物結(jié)合口袋的螺旋區(qū)域受到了二聚體界面相互作用的約束,不似單體中那樣靈活??偟膩碚f,Ser189 O-GlcNAc可以充當(dāng)“分子膠”的作用,通過穩(wěn)定MDH1單體上的底物結(jié)合口袋,增強(qiáng)蛋白與底物,底物與底物之間的相互作用,來提高底物的結(jié)合及穩(wěn)定性,最終促進(jìn)MDH1的酶活性。

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圖2:MDH1 Ser189位上的O-GlcNAc糖基化促進(jìn)其酶活性的分子機(jī)理

綜上所述,該研究揭示了OGT-MDH1軸在PDAC發(fā)生和發(fā)展過程中的重要功能。鑒于MDH1在PDAC中高表達(dá),且MDH1糖基化水平與PDAC進(jìn)程呈正相關(guān),該研究成果提示干預(yù)MDH1糖基化可以作為靶向PDAC的潛在策略。

 
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圖3:MDH1糖基化調(diào)控PDAC生長的工作模式圖

教育部“生命系統(tǒng)穩(wěn)態(tài)與保護(hù)”重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、浙江大學(xué)上海高等研究院、浙江大學(xué)癌癥研究院周如鴻教授和易文教授為論文的共同通訊作者。浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士后朱強(qiáng)和周紅為論文的共同第一作者,王勇研究員也參與了這項(xiàng)工作。 

論文鏈接: 
https://www.nature.com/articles/s41589-022-01085-5

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